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如何選擇適合的濾膜，主要取決于濾膜與所過濾的流體（水性溶液or有機(jī)溶液or兩性溶液）之間的化學(xué)相容性。
1) 尼龍膜和親水PTFE膜，由于其廣泛的化學(xué)相容性，主要應(yīng)用于HPLC相關(guān)的過濾中。可用于水性溶液和有機(jī)溶液的過濾。
2) 親水PVDF和PES膜，由于其低蛋白吸附特性，主要用于蛋白溶液的過濾。也可用于溫和的有機(jī)溶液過濾。
3) 疏水PTFE膜，由于其廣泛的化學(xué)相容性，主要用于有機(jī)溶液的過濾。
4) MCE膜，主要用于水性溶液的過濾和分析監(jiān)測。